明成祖朱棣建都北京以后，真定府直隶于京师，宣德五年(公元1430年）从西安调拨神武右卫到真定府，建立神武右卫指挥使司，作为真定、保定府及周围诸州包括衡水在内驻军的最高指挥机构，时真定不仅是控制5州11县的政治中心，而且是控制燕晋咽喉的交通中心，成为拱卫京师的主要城镇，在政治、军事方面，真定府的地位与顺天府（北京）十分接近。
清朝入关之初，直隶真定府仍辖领5州13县。顺治十三年（公元1656年）在北京之外的直隶地区，设立保定巡抚，驻真定。顺治十六年（公元1659年），改保定巡抚为直隶巡抚，从真定徙治保定。 雍正元年（公元1723年），因为避讳世宗皇帝胤禛名讳，改真定为正定，真定府和真定县从此改称正定府、正定县。雍正二年(公元1724年）开始调整政区体系，将原来由各府管辖的州，升为直隶于省的直隶州，缩小了府一级政区的范围，事实上也削弱了府的行政权力，同时提高了州作为二级政区的政治地位。正定府辖领正定、获鹿、井陉、平山、藁城、行唐、灵寿、元氏、赞皇、无极、栾城、新乐、晋州等13州县。
民国二年（公元1913年），直隶省除顺天府外，其他府州皆废，由省辖县，真定府的历史终结。
